Zilly ist eine ehemals selbständige Gemeinde. Vom 11.9.2003 bis 31.12.2009 Ortsteil der Gemeinde Aue-Fallstein, Kreis Harz (bis 1.7.2007 Kreis Halberstadt), ab 1.1.2010 (zusammen mit Aue-Fallstein) Ortsteil der Stadt Osterwieck im Landkreis Harz in Sachsen-Anhalt.